Résistance au chloramphénicol dans les produits de l'aquaculture du Sud-est asiatique

ASIARESIST a étudié la résistance aux antibiotiques de bactéries provenant des produits d'aquaculture du Sud-est asiatique et exportés vers l'Europe. Les antibiotiques sont largement utilisés dans les exploitations piscicoles du Sud-est asiatique, suscitant des inquiétudes quant au développement de bactéries résistantes. Ce qui risquerait de mettre en danger la santé publique et menacerait non seulement la productivité mais également toute l'économie locale. Par conséquent, il était essentiel d'adopter des mesures de contrôle du risque afin d'assurer une gestion efficace de l'écosystème.

Le projet ASIAREST s'est chargé de l'identification fiable des bactéries résistantes à l'antibiotique chloramphénicol (CHL) en utilisant d'abord la technique de réaction en chaîne par polymérase sur des séquences chromosomales répétitives (repPCR, pour repetitive chromosomal element-polymerase chain reaction). À partir des profils PCR obtenus, des copies CHL potentielles ont été identifiées et mis de côté. Les échantillons restants ont été soumis à une chromatographie gaz-liquide afin d'analyser le profil d'esters méthyliques d'acides gras cellulaire (EGMA).

Les profils EGMA des échantillons inconnus ont été comparés avec la base générale de données TSBA dans une tentative de classification, au moins au niveau de la famille bactérienne. Permettant ainsi l'élaboration du premier compte rendu de bactéries résistantes au chloramphénicol pour l'aquaculture du Sud-est asiatique.