Les microbiologistes spécialistes de la faune marine vont bientôt pouvoir utiliser une banque interactive de données méta-génomiques leur permettant un accès aux informations les plus récentes concernant l'écologie microbienne. Cette banque regroupe toutes les recherches en cours dans le domaine, y compris celles déjà publiées, mais qui n'ont pas encore été intégrées dans le consensus principal de la discipline.

Les recherches en génomique ont marqué un tournant important pour le développement des sciences biologiques. Dans aucune autre discipline ce changement ne s'est révélé aussi fondamental. L'approche génomique est particulièrement adaptée à l'étude de ces procaryotes aux caractéristiques morphologiques et métaboliques simples.

Le groupe de génomique évolutionnaire de l'université Miguel Hernández (Espagne) s'est attaché à comprendre l'évolution de la faune microbienne. L'équipe participe également au développement de banques de données et d'outils bioinformatiques ainsi qu'à la gestion de ces instruments en relation avec l'écologie microbienne, le tout formant ainsi le cadre méthodologique de ce groupe. C'est dans ce contexte que les chercheurs ont créé Micro-Mar, une base de données dynamique intégrant les données méta-génomiques et la biodiversité microbienne.

La base de données contient principalement les séquences publiques des procaryotes marins en relation avec leurs profils géographiques et écologiques. Chaque entrée de la banque de données représente un procaryote marin unique associé à une ou plusieurs séquences d'ADN provenant d'échantillons individuels prélevés sur un site bien spécifique et à une certaine profondeur. Cette base de données est particulièrement destinée aux biologistes marins, qui peuvent y avoir accès comme à un livre virtuel et interactif intégrant des informations qui ont souvent déjà été publiées, sans pour autant avoir été correctement intégrées dans le courant dominant de pensée de la biologie marine.

Ces recherches ont été effectuées dans le cadre du projet GEMINI mené par l'UE. Le projet GEMINI s'est fixé comme objectif l'exploitation du vaste potentiel génétique de la méta-génomique. Les membres du consortium ont pu atteindre cet objectif en combinant le potentiel énorme de la biodiversité microbienne avec les technologies les plus avancées de dépistage, de biologie moléculaire et de bioinformatique. Ils cherchent maintenant à utiliser ces acquis pour développer des produits à haute valeur ajoutée biotechnologique ou pharmaceutique.

 

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